Zum Geschäftsbereich des Bundesministeriums für Ernährung und Landwirtschaft (BMEL) gehören folgende nachgeordnete Behörden und Forschungsinstitute:
- Julius Kühn-Institut – Bundesforschungsinstitut für Kulturpflanzen
- Friedrich-Loeffler-Institut - Bundesforschungsinstitut für Tiergesundheit
- Max Rubner-Institut - Bundesforschungsinstitut für Ernährung und Lebensmittel
- Johann Heinrich von Thünen-Institut - Bundesforschungsinstitut für Ländliche Räume, Wald und Fischerei
- Bundessortenamt
- Bundesamt für Verbraucherschutz und Lebensmittelsicherheit
- Bundesinstitut für Risikobewertung
- Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung