In einer weltweit einzigartigen Einführungsshow begleiten die Besucher zunächst die Unterwasserforscher bei Ihrer Arbeit. Sie tauchen in eine nachgebaute Unterwasserwelt ein und erleben ein authentische im 360-Grad-Panoramakino mit 13 Beamern rekonstruiertes Pfahlbaudorf.
Ein Rundgang durch die Freilichtanlage über dem Bodensee mit sachkundigen Erläuterungen in den eingerichteten Häusern schließt sich an.
Die Ausstellung zum UNESCO-Weltkulturerbe mit 1000 Originalfunden zeigt, was die Menschheit geerbt hat und verstärkt unter Wasser zu schützen ist.
Funde aus dem Bodensee, dem Federsee und einzigartige Kostbarkeiten des Pfahlbauforschens aus der Schweiz lassen sich begutachten. Im Pfahlbaumuseum Unteruhldingen wird die Geschichte des Bodensees im Herbstprogramm lebendig.
Bei Individualführungen für Reisegruppen und Schwerpunktführungen für Schulgruppen wird auf Wunsch "Feuermachen wie in der Steinzeit" gezeigt.
Mit Zunder, Pyrit und Schilfsamen entsteht lebenserhaltende Wärme. Mit Feuer wurde gekocht und Metall geschmolzen. Auch Äpfel wurden gerade jetzt im Herbst schon zur Steinzeit vor mehr als 5000 Jahren geerntet, gedörrt und als Wintervorrat eingelagert.
Die noch erhaltenen Apfelhälften aus der Steinzeit sind in der Sonderausstellung "Das Erbe der Pfahlbauer" aber im Rahmen des 6. Steinzeit-Apfelfests am 13. Oktober im Pfahlbaumuseum zu sehen.