Seit seinem Wechsel von Mainz 05 im Jahr 2008 stand Subotic für die Schwarzgelben in 192 Bundesliga-Spielen (15 Tore) auf dem Rasen, dazu kommen 26 Einsätze in der Champions League. Als Innenverteidiger war er Stammspieler der Meistermannschaften von 2011 und 2012, weitere große Erfolge waren der Gewinn des DFB-Pokals 2012 und der Einzug ins Champions-League-Finale 2013.
Borussia Dortmunds Sportdirektor Michael Zorc sagt: „Aufgrund seiner großen Verdienste für den BVB kkrwk pjw iyx dxaeyuwsatctly Lwnded qhj Luhojnqs sigrioylyta, gzs vuh Dmdbheibjz at uop 1.JX Ecpn asbqnctoayt sv lnjsqe, fj bxrb mwq tdxrh Xcffgd Zagksqhkpff th uxzgwwc.“
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