Zahlreiche Monographien und selbstständige Veröffentlichungen zu allen Kernbereichen des Europarechts sowie Bezüge zum nationalen Staats- und Verwaltungsrecht sind ein eindrucksvoller Beleg der Schaffenskraft von Prof. Dr. Jürgen Schwarze. Das Werk „Europäisches Verwaltungsrecht“ gilt als moderner Klassiker des Europarechts. Darüber hinaus hat er führende Kommentare zum Europarecht sowie mehrere Schriften zum Europäischen Wettbewerbsrecht mit herausgegeben.
Seit 1989 ist Jürgen Schwarze ordentlicher Professor für Deutsches und Ausländisches Öffentliches Recht, Europa- und Völkerrecht an der Universität Freiburg. Als Direktor des Instituts für Öffentliches Recht leitet er die Abteilung Europa- und Völkerrecht sowie das Europainstitut Freiburg e.V.