Der studierte Betriebswirt Hagen Brandstäter arbeitete ab 1990 beim WDR, wo er zunächst im Bereich Organisation und EDV tätig war. In der Intendanz des Senders war er Referent der Intendanten Friedrich Nowottny und Fritz Pleitgen. Später übernahm er verschiedene Funktionen in der Verwaltungsdirektion des WDR. Von 1999 an leitete er die Abteilung Produktionswirtschaft und IT-Strategie in der WDR-Produktionsdirektion.
Seit Mai 2003 ist Hagen Brandstäter Verwaltungsdirektor des rbb. Er leitet die ARD/ZDF-Arbeitsgruppe "Rundfunkgebühren".